Alors qu’auparavant, nous considérions les intestins comme un simple organe digestif, nous savons aujourd’hui qu’ils fonctionnent comme une sorte de deuxième cerveau. Le microbiome intestinal joue un rôle important dans le système immunitaire, le métabolisme et le bien-être mental. Des études montrent qu’un microbiome perturbé contribue à près de 80 % des troubles de santé mentale, notamment la dépression et l’anxiété. Le lien entre les intestins et la santé mentale, également appelé « axe intestin-cerveau », devient de plus en plus évident.
De plus, une autre étude a montré que la constipation chronique, souvent causée par un déséquilibre des bactéries intestinales, est associée à une augmentation de 73 % du risque de déclin cognitif. Cela peut en fait faire vieillir votre cerveau de trois ans.
Il n’est donc pas étonnant que les thérapies visant à rétablir la santé intestinale gagnent en popularité. L’un des traitements les plus originaux ? Les pilules à base de matières fécales, également connues sous le nom de capsules FMT (transplantation de microbiote fécal). Les premiers résultats sont prometteurs, mais la consommation de matières fécales transformées peut-elle vraiment aider à lutter contre la dépression, les troubles de la mémoire ou le stress ?
Examinons cela de plus près.
Que sont les pilules pour les selles et comment fonctionnent-elles ?
Les pilules de selles, également connues sous le nom de capsules FMT (transplantation de microbiote fécal), sont des capsules remplies de selles lyophilisées et transformées provenant de donneurs sains soigneusement sélectionnés. Ces capsules contiennent une communauté microbienne complète, comprenant des bactéries, des champignons et d’autres micro-organismes, qui peut aider à rétablir l’équilibre d’un microbiome intestinal perturbé.
Chaque capsule est conçue pour résister à l’acidité gastrique et ne libérer son contenu que dans l’intestin grêle et le côlon. Là, les microbes sains provenant du donneur peuvent éliminer les bactéries nocives et reconstituer les populations bactériennes épuisées. Ce processus, également appelé restauration du microbiome, vise à favoriser un microbiome sain et une santé intestinale équilibrée.
À l’origine, les capsules FMT ont été développées pour traiter les infections récurrentes à Clostridioides difficile (CDI), une prolifération bactérienne dangereuse et résistante aux antibiotiques. En 2023, la FDA américaine a approuvé Vowst™, le premier traitement par transplantation microbienne fécale orale pour les CDI. Depuis, des scientifiques aux Pays-Bas, au Canada et aux États-Unis étudient également ce traitement pour des applications plus larges, telles que les maladies inflammatoires de l’intestin (MII), le syndrome du côlon irritable (SCI), les troubles de l’humeur liés à l’intestin et à la santé mentale, et l’obésité due à un microbiome perturbé.
Qu'est-ce que le microbiome intestinal et pourquoi est-il important ?
Le microbiome intestinal est un écosystème vivant composé de milliards de micro-organismes (bactéries, champignons, virus et autres microbes) qui vivent dans le tube digestif. Lorsqu’ils sont en bonne santé, ils travaillent ensemble pour :
- Soutenir la digestion et l’absorption des nutriments
- Produire des vitamines et d’autres substances bioactives
- Protéger contre les agents pathogènes nocifs
- Réguler le système immunitaire
- Communiquer avec le cerveau par le biais de signaux chimiques
Cet équilibre est essentiel. Lorsque la diversité microbienne diminue – un trouble appelé dysbiose –, les effets peuvent aller bien au-delà des simples troubles digestifs. La dysbiose est associée à une mauvaise santé intestinale, comme les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), le syndrome métabolique, les maladies auto-immunes et même la dépression. La meilleure façon d’améliorer cette condition est de veiller à une bonne santé intestinale.
Comment vos intestins influencent-ils votre cerveau et votre humeur ?
Les intestins et le cerveau sont en contact permanent via ce que l’on appelle l’axe intestin-cerveau : un réseau de communication bidirectionnel qui relie le système nerveux entérique (le « deuxième cerveau » situé dans vos intestins) au système nerveux central. Cette communication s’effectue simultanément via plusieurs canaux :
- Voies neuronales via le nerf vague
- Voies immunitaires par le biais de cytokines inflammatoires
- Voies endocriniennes avec des hormones telles que le cortisol
- Métabolites microbiens tels que les acides gras à chaîne courte et les neurotransmetteurs
Des recherches montrent qu’environ 90 % de la sérotonine présente dans l’organisme, un neurotransmetteur important qui régule l’humeur, est produite dans les intestins et envoyée au cerveau via ces voies neurales, immunitaires, endocriniennes et métaboliques.
Lorsque le microbiome est déséquilibré, cette transmission de signaux peut être altérée. Cela peut influencer le taux de sérotonine, la réponse au stress et les processus inflammatoires, augmentant ainsi le risque d’anxiété, de dépression et de déclin cognitif. En résumé, l’état de votre microbiome intestinal peut avoir une influence directe sur la chimie et le fonctionnement de votre cerveau.
Quelle preuve établit un lien entre les pilules à base de matières fécales et l'amélioration de la santé mentale ?
Les recherches sur les bienfaits des pilules à base de matières fécales pour la santé mentale en sont encore à leurs débuts, mais le lien entre les intestins et la santé mentale justifie pleinement l’étude de cette relation.
Données précliniques
Des études sur des animaux ont montré que le transfert du microbiome intestinal de personnes dépressives à des souris exemptes de germes peut provoquer un comportement de type dépressif. À l’inverse, la transplantation d’un microbiome sain peut améliorer l’humeur et les performances cognitives chez les modèles animaux.
Premières constatations chez l’être humain
Bien que les recherches chez l’homme n’en soient qu’à leurs débuts, les premiers résultats sont encourageants :
- Dépression et anxiété : de petites études pilotes ont montré une amélioration de l’humeur chez les patients souffrant de dépression résistante au traitement après une transplantation de microbiome fécal, bien que le nombre de participants soit encore limité.
- SII avec anxiété associée : certains patients ayant reçu des gélules de FMT ont signalé non seulement un soulagement des symptômes gastro-intestinaux, mais aussi une diminution de leur score d’anxiété.
- Fonction cognitive : des données préliminaires suggèrent des avantages potentiels dans le cas d’un déclin cognitif lié à l’âge, mais ces résultats sont encore exploratoires.
Conclusion à ce jour
Ensemble, ces études suggèrent que les gélules de FMT pourraient jouer un rôle plausible dans les soins de santé mentale, en particulier pour les personnes souffrant à la fois de problèmes intestinaux et de troubles de l’humeur. Cependant, la plupart des preuves sont encore provisoires. De vastes études cliniques contrôlées par placebo seront essentielles pour confirmer si les pilules à base de matières fécales peuvent constituer un traitement fiable pour l’humeur, les fonctions cognitives et la santé mentale liées à l’intestin.
Qui peut bénéficier d'une transplantation de microbiote fécal (TMF) ?
À l’heure actuelle, l’utilisation la plus courante et la plus éprouvée des gélules FMT est le traitement des infections récurrentes à Clostridioides difficile (ICD) qui ne répondent pas aux antibiotiques. Dans ce cas, des essais cliniques ont montré des taux de guérison supérieurs à 80 %.
En outre, les scientifiques étudient si la restauration du microbiome par FMT peut aider à traiter les troubles liés à la dysbiose intestinale, notamment :
- Syndrome du côlon irritable (SCI) : lorsque les symptômes sont graves et que les probiotiques ne soulagent pas.
- Colite ulcéreuse et maladie de Crohn : pour réduire l’inflammation et favoriser la rémission.
- Troubles du spectre autistique : pour soulager les symptômes gastro-intestinaux pouvant influencer le comportement.
- Dépression et anxiété avec dysbiose confirmée : pour influencer les intestins et la santé mentale via l’axe intestin-cerveau.
- Restauration du microbiome après un traitement antibiotique : pour restaurer la diversité après un traitement antibiotique à large spectre.
Comme toutes les affections intestinales ne sont pas dues à une dysbiose, il est essentiel de sélectionner correctement les patients. Un test complet du microbiome intestinal permet d’identifier une faible diversité, une prolifération bactérienne nocive ou d’autres déséquilibres, ce qui permet aux professionnels de santé de déterminer si les capsules de FMT constituent une option appropriée.
Risques, effets secondaires et restrictions liés aux gélules FMT
Bien que les capsules FMT soient prometteuses, elles soulèvent également d’importantes questions médicales et éthiques :
- Transmission d’agents pathogènes : même avec un dépistage approfondi des donneurs, des infections peuvent survenir dans de rares cas.
- Réactions immunitaires : les modifications du microbiome peuvent influencer l’activité immunitaire de manière imprévisible.
- Effets indésirables : des études de cas décrivent des changements tels que la prise de poids ou des problèmes cutanés, probablement liés à l’influence du microbiome intestinal sur le métabolisme et l’immunité.
- Restrictions réglementaires : en dehors des infections récurrentes à C. difficile, son utilisation reste largement expérimentale.
En raison de ces risques, la FMT ne doit être pratiquée que sous surveillance médicale et avec des matériaux cliniquement approuvés. Les approches non contrôlées ou artisanales peuvent exposer les receveurs à des dommages graves et évitables.
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Un test microbiologique peut-il aider à déterminer si vous avez besoin de pilules pour aller à la selle ?
Oui, mais la valeur réside dans la précision. Un test complet du microbiome intestinal examine des échantillons de selles afin d’évaluer :
- Diversité du microbiome.
- Équilibre entre les bactéries bénéfiques et nocives.
- Marqueurs inflammatoires.
- Activité métabolique, telle que la production de substances et d’enzymes importantes.
Ces informations peuvent révéler des schémas et des aspects cachés de votre santé intestinale, tels qu’une faible diversité ou une prolifération pathogène, et aider les professionnels de santé à déterminer s’ils doivent d’abord envisager des changements alimentaires, des probiotiques ou des capsules de FMT pour une restauration plus intensive du microbiome.
Un test microbiologique peut-il aider à déterminer si vous avez besoin de pilules pour aller à la selle ?
| Intervention | Microscope microbien | Début de l'effet | Risques | Preuves cliniques |
|---|---|---|---|---|
| Capsules FMT | Full donor microbiome | Jours à semaines | Infection, réponse immunitaire | Solide pour CDI ; émergent pour les autres |
| Probiotiques | Souches sélectionnées | De quelques semaines à plusieurs mois | Minimal chez les adultes en bonne santé | Modéré pour le syndrome du côlon irritable, la diarrhée et certains effets sur l'humeur. |
| Changements alimentaires | Soutien du microbiome endogène | De quelques semaines à plusieurs mois | Aucun si équilibré | Efficace pour la prévention, santé intestinale à long terme |
Différence importante : les probiotiques et une alimentation saine agissent progressivement en renforçant les microbes bénéfiques déjà présents. La FMT apporte une communauté microbienne entièrement nouvelle et peut souvent entraîner des changements plus rapides, mais elle comporte un risque plus élevé de complications médicales.
L'avenir des thérapies intestin-cerveau et de la médecine du microbiome
La recherche évolue rapidement vers une médecine microbiologique de précision : des interventions adaptées à des maladies spécifiques, à des patients spécifiques et même à des profils génétiques individuels. Au cours des prochaines années, les scientifiques travailleront sur :
- Capsules FMT ciblées contenant des souches microbiennes définies et validées cliniquement, sélectionnées pour traiter des affections spécifiques et optimiser les résultats thérapeutiques.
- Microbiomes synthétiques conçus en laboratoire pour fournir des compositions microbiennes précises, tout en éliminant pratiquement tout risque de transmission d’agents pathogènes.
- Thérapies combinées intégrant la FMT à des interventions alimentaires fondées sur des preuves, des prébiotiques ou des psychobiotiques afin d’accroître la stabilité du microbiome et de maintenir les avantages cliniques.
- Des biomarqueurs intestin-cerveau développés pour mesurer, surveiller et prédire avec précision la réponse au traitement des troubles mentaux et neurologiques liés au microbiome.
Une application à grande échelle nécessite des normes de sécurité strictes, un suivi à long terme pour confirmer les avantages durables et une intégration avec des traitements éprouvés pour la santé mentale et le microbiome intestinal. En cas de succès, ces développements pourraient faire passer la FMT d’une thérapie expérimentale à une pierre angulaire de la médecine personnalisée intestin-cerveau.
Conclusion
Les pilules à base de matières fécales ne sont plus un concept marginal. Sous forme de transplantations microbiennes fécales encapsulées, elles ont le potentiel de restaurer rapidement un microbiome intestinal endommagé et d’influencer ainsi l’axe intestin-cerveau d’une manière qui peut être bénéfique pour la santé mentale.
Il ne s’agit toutefois pas d’un traitement auto-prescrit. À l’heure actuelle, les gélules FMT constituent un traitement réglementé pour les infections récurrentes à C. difficile et un remède expérimental pour d’autres affections. Si vous pensez qu’une mauvaise santé intestinale affecte votre bien-être mental, l’approche la plus sûre consiste à consulter un médecin ou à effectuer un test de santé intestinale à domicile. Vous pourrez ainsi explorer toutes les options disponibles, du régime alimentaire aux probiotiques en passant par les gélules FMT approuvées cliniquement.
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Sources
- NHMRC. Trust your gut: how the microbiome impacts mental health.
- Health. Chronic Constipation Linked to Higher Risk of Cognitive Decline.
- Dutch News. Leiden microbiologists develop “poo pill” to treat gut disorders.
- NTVO. Fecale transplantatie van de juiste donor kan risico op darmkanker mogelijk verkleinen.
- CGH Journal. Effects of Fecal Microbiota Transplantation With Oral Capsules in Obese Patients.
- Wikipedia. Gut–brain axis.
- NIH. Exploring the serotonin‐probiotics‐gut health axis: A review of current evidence and potential mechanisms.
- YouTube. How Your Gut Bacteria Controls Your Mood.
- Easly. Microbioomtest.
- Netflix. Hack Your Health: The Secrets of Your Gut.
