Les microbes présents dans notre corps maintiennent notre système immunitaire en bonne santé et assurent la dégradation des substances que nous ne pouvons pas digérer nous-mêmes. Lorsque le microbiome est déséquilibré, cela a donc de nombreuses conséquences néfastes. Une raison suffisante pour plonger dans le microcosme des bactéries et autres micro-organismes présents dans notre corps dans cet article.
Qu'est-ce que le microbiome ?
On ne le croirait pas, mais il y a autant de micro-organismes dans et sur votre corps que vous avez de cellules. L’ensemble de ces micro-organismes est appelé microbiome. La composition du microbiome est très diversifiée. Votre bouche, vos intestins et votre peau abritent différents groupes de virus, champignons et bactéries. Ils ont tous en commun d’interagir avec votre corps et d’avoir une influence considérable sur votre santé, tant positive que négative.
Les intestins à l'honneur
Comme nous l’avons déjà mentionné, les milliards de micro-organismes qui composent le microbiome se trouvent à différents endroits sur et dans votre corps. Cependant, le microbiome intestinal joue un rôle prépondérant. En effet, votre flore intestinale abrite d’innombrables bactéries qui participent à la digestion des aliments et peuvent influencer votre santé de multiples façons. Le microbiome intestinal est unique à chaque individu. Sa constitution commence dès la naissance, puis s’enrichit progressivement au fil de l’exposition à différents types d’aliments et au monde extérieur.
Les êtres humains entretiennent une relation symbiotique avec les bactéries présentes dans leur intestin. Les microbes bénéficient de l’environnement protégé de nos intestins et aident notre corps à décomposer les glucides complexes et les fibres alimentaires, que nous ne pouvons pas décomposer nous-mêmes. Les bactéries du microbiome intestinal produisent également des acides gras et jouent un rôle important dans le métabolisme des vitamines. Elles génèrent par exemple les enzymes nécessaires à la production des vitamines B1 et B12.
Les bactéries intestinales entraînent également votre système immunitaire à distinguer les bonnes bactéries des mauvaises et à recycler la bile utilisée dans l’intestin grêle pour digérer les graisses. Il est également utile que les « bonnes » bactéries rivalisent avec les « mauvaises » bactéries. Cela empêche les microbes nuisibles de prendre le dessus.
Types de bactéries présentes dans vos intestins
Votre intestin peut contenir plus de 1 000 espèces de bactéries, mais chez la plupart des gens, « seules » quelques centaines d’espèces sont actives. Celles-ci peuvent être classées en cinq souches différentes :
- Bactéroïdes
- Protéobactéries
- Verrucomicrobia
- Actinobactéries
- Firmicutes
Les bactéries connues dans le microbiome sont, par exemple, les bactéries prevotella, présentes dans l’estomac et dans la bouche, et la bactérie E. coli, l’un des micro-organismes les plus courants dans le côlon.
Une analyse du microbiome permet de déterminer précisément quelles bactéries sont présentes dans vos intestins et dans quelles proportions. Pour cela, l’ADN d’un échantillon de selles (qui contient de nombreuses bactéries mortes) est analysé. Les résultats de cette analyse du microbiome intestinal permettent ensuite de déterminer si votre microbiome est équilibré ou s’il présente des déséquilibres qui doivent être corrigés, par exemple en modifiant votre alimentation.
Causes et symptômes d'une mauvaise flore intestinale
Chacun possède une flore intestinale différente ; la composition de votre flore intestinale dépend de nombreux facteurs, notamment vos habitudes de vie, votre consommation de médicaments et vos antécédents médicaux.
Une flore intestinale malsaine est une flore déséquilibrée, ce qui perturbe la répartition entre les bonnes et les mauvaises bactéries. Ce déséquilibre peut entraîner divers symptômes intestinaux, tels que :
- Douleurs abdominales
- Flatulences
- Diarrhée
- Constipation
- Fatigue
- Perte d’appétit
En outre, une flore intestinale malsaine peut entraîner des problèmes de digestion et d’absorption des nutriments. Cela peut conduire à une carence en nutriments importants tels que les vitamines et les minéraux, ce qui entraîne toute une série de troubles physiques. De plus, les mauvaises bactéries présentes dans l’intestin peuvent provoquer la production de gaz, qui peuvent entraîner des douleurs abdominales, des flatulences et des ballonnements. Une flore intestinale malsaine peut également entraîner des diarrhées et de la constipation.
Les causes d’une flore intestinale malsaine sont diverses et complexes et font actuellement l’objet de nombreuses recherches. L’une des principales causes d’un microbiome perturbé est en tout cas un mode de vie malsain, tel que :
- Une alimentation riche en aliments transformés et pauvre en fibres,
- Le stress,
- Le manque d’activité physique.
Des recherches ont montré que les personnes atteintes de certaines maladies présentent une composition modifiée du microbiome. Nous ne savons toutefois pas encore si cette modification est due à la maladie ou si c’est justement le microbiome modifié qui a causé la maladie.
Il est important de savoir qu’une flore intestinale malsaine ne provoque pas toujours des symptômes. Certaines personnes ont une flore intestinale perturbée sans en souffrir. À l’inverse, des personnes souffrant de troubles intestinaux peuvent avoir une flore intestinale saine. C’est pourquoi il est important d’être à l’écoute de son corps et de consulter un médecin en cas de troubles intestinaux persistants.
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Le microbiome et les maladies courantes
Lorsque le microbiome est déséquilibré, les bactéries nocives peuvent prendre le dessus. Dans les cas les plus graves, des maladies peuvent apparaître. Voici quelques maladies gastro-intestinales courantes liées à un microbiome perturbé :
- La maladie de Crohn. Cette maladie se caractérise par une inflammation chronique du tube digestif.
- Le syndrome du côlon irritable. Le côlon est alors trop actif ou, au contraire, inactif. Cette maladie est très fréquente. Elle se manifeste notamment par des douleurs abdominales, des flatulences, des ballonnements et des troubles intestinaux.
- Cancer colorectal. Dans le cas de cette maladie potentiellement mortelle, un ou plusieurs polypes présents sur la paroi intestinale se transforment en tumeurs malignes.
- Maladies auto-immunes. Par exemple, la sclérose en plaques et la polyarthrite rhumatoïde. Dans les deux cas, le système immunitaire s’attaque à son propre organisme.
- Diabète de type 2. Dans le cas de cette maladie, la régulation du taux de sucre dans le sang est perturbée, ce qui entraîne un excès de sucre dans le sang. Cela a toutes sortes d’effets négatifs sur la santé.
Que faire après une maladie ou une cure d'antibiotiques ?
Les maladies et les antibiotiques peuvent perturber la santé intestinale. En effet, un traitement antibiotique ne s’attaque pas uniquement aux agents pathogènes. Certaines « bonnes » bactéries sont également sensibles aux antibiotiques. La disparition de ces « bonnes » bactéries laisse alors la place à des bactéries nocives. Une bonne alimentation (voir ci-dessus) et/ou la prise de probiotiques peuvent vous aider à rétablir votre flore intestinale.
Conseils nutritionnels pour une bonne flore intestinale
Une alimentation saine et variée, riche en fibres, fruits et légumes, est le meilleur moyen de préserver votre santé intestinale. Il est également important de boire beaucoup d’eau et de consommer des aliments riches en fibres. Les fibres procurent en effet une sensation de satiété et favorisent le transit intestinal. Limitez votre consommation de sucre, car les mauvaises bactéries et les champignons s’en nourrissent.
Les probiotiques et les prébiotiques peuvent également contribuer à améliorer la santé intestinale. Les probiotiques sont des bactéries vivantes que l’on trouve notamment dans les aliments fermentés tels que le yaourt, le babeurre et la choucroute. Les prébiotiques sont des fibres alimentaires qui ne sont pas digérées par votre corps, mais qui servent de carburant aux bonnes bactéries. On les trouve par exemple dans les oignons, l’avoine, les bananes et l’ail.
Comment vérifier si tout va bien dans votre ventre ?
Pour cela, vous pouvez faire un test microbiologique. Pas besoin d’aller à l’hôpital ou chez le médecin : des experts médicaux ont mis au point un test à faire chez soi pour Easly. Il suffit d’envoyer un échantillon de selles à notre laboratoire, où l’ADN de vos selles sera analysé à l’aide de la toute dernière technique de séquençage longue lecture de troisième génération. Cela permettra de déterminer la diversité de votre microbiome. Vous recevrez également des conseils nutritionnels pour vous aider à maintenir ou à rétablir l’équilibre de votre microbiome.
